Diese Überlegung habe ich auch schon angestellt. Statt "nur" MP3-player habe ich mir gleich einen ganzen Notebook eingebaut. Die Musik daraus wir momentan noch per Adapterkassette eingespeist, was aber nicht das wahre ist.
Das "Bose" Radio hat, ausser dem Schriftzug vorne, nix mit Bose zu tun. Es ist ein ganz normales Autoradio ohne Endstufe. Daher passen auch Ein- und Ausgangsimpedanz. Das MP3 Audiosignal kann also direkt am Radio angestöpselt werden.
Was ich nocht nicht weiss ist wie der Eingang in Bezug auf den CD-player reagiert. Er könnte ständig offen sein, was gut wäre, oder aber auch, zumindest bei CD Wechsel, an- und abgeschalten werden. Da hilft nur probieren.